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碇ゲンドウはINTJ（建築家）型であり、その性格はNERV総司令としての行動原理に深く根ざしています。INTJの核である「目的達成のための戦略的思考」は、彼が「人類補完計画」を遂行するために、息子シンジを含むすべてを冷徹に駒として扱う姿勢に明確に表れています。彼は感情や倫理よりも論理と効率を優先し、亡き妻ユイとの再会という個人的な悲願を究極の目標として掲げ、その実現のためには手段を選びません。作品内での彼の役割は、人類の運命を左右する巨大な計画の最高責任者であり、使徒との戦闘を指揮する絶対的な権力者です。他のキャラクターとの関係性では、特に息子シンジに対しては、愛情を示すことなく道具として接し、その複雑な親子関係は物語の重要なテーマとなっています。また、副司令の冬月コウゾウとは、彼の計画を理解し支える数少ない協力者として、強い信頼関係で結ばれています。ゲンドウの魅力は、その底知れない知性と、冷酷さの裏に秘められた強烈な情熱、そして「神」に匹敵するような巨大な計画を一人で推進するカリスマ性にあります。彼はエヴァンゲリオンの世界観において、最も複雑で謎めいたアンチヒーロー的存在として、視聴者に強烈な印象を残します。